Il Centro Universitario di Microscopia Elettronica (CUME) è stato istituito nel 1970, ed è attualmente ubicato presso al Piano -2 dell'Ellise.
Il Cume è un centro di servizi che mette a disposizione degli utenti una serie di strumenti all'avanguardia per la ricerca sia nei settori biologici che abiologici, unitamente ad un valido supporto del personale tecnico in forza al CUME.
E' utilizzato prevalentemente da ricercatori dell'Università degli Studi di Perugia ma non mancano ricercatori provenienti da altri atenei e da laboratori non universitari.